L’apothicairerie de l’hôtel-Dieu a été reconstituée dans ses lambris d’origine, présentant ainsi l’un des plus ensembles de céramiques pharmaceutiques de France. La plupart sont issues des manufactures de Rouen, Nevers et Saint-Cloud.
Fondation royale ou monastique, l’Hôtel-Dieu était l’une des principales institutions de la ville de Saint-Denis.
Centre hospitalier dont l’origine remonte probablement à l’époque mérovingienne, il fut édifié près de l’abbaye. En effet, au Moyen Âge, les œuvres de charité étaient prises en charge par les institutions religieuses, ce qui explique cet emplacement.
Reconstruit en 1713, cet hôpital, centre de bienfaisance, comptera jusqu’à trente-quatre lits au début du XVIIIe siècle, et mènera une politique active de soins en direction de la population.
La sacristie du Carmel, transformée en chapitre au XVIIIe siècle, puis en parloir, accueille aujourd’hui de nombreux souvenirs de ce bâtiment. Après la démolition en 1907 de l’Hôtel-Dieu, ses collections furent affectées au musée.